被称为大海恶霸的巨牙鲨在近海区几乎所向无敌。珊瑚枝并不会成为它们的阻碍，那口连铁板都能刺穿的獠牙会轻易咬断枝条，将躲藏在其中的鱼宝可梦啃食殆尽，即使是凶恶的野蛮鲈鱼都不敢与鲨鱼群争锋。
幸好，巨牙鲨并不是这一带的常驻民，仅仅是跟随洋流路过，想必明天便会不见踪影。在绝大多数时候，珊瑚枝依旧是小鱼们安全的庇护所。
每到春夏时节，大量的弱丁鱼便会聚集在珊瑚海，进入一年一度的繁衍期。对于平均体长只有0.2m的弱丁鱼而言，像大型宝可梦那样生蛋孵化是几乎无法承受的负担。但小家伙自然也有小家伙的生存之道。
日色西沉，雌性弱丁鱼开始活跃起来。它们在珊瑚枝之间选定心仪的位置，开始产出半透明的鱼卵，雄性则争相为鱼卵受精。在接下来的几天内，受精的鱼卵吸收浅海丰富的营养物质，渐渐发育膨胀，长出不透明的硬壳，变为我们熟悉的宝可梦蛋的模样；而再过一周，它们将会孵化出鱼苗，在一个无风无浪的白天一同启程，前往大海深处遨游。
对于捕食者们而言，弱丁鱼的鱼卵是营养价值极高的美餐。一夜过去，雪白的卵几乎将珊瑚礁掩埋，它们很快便会被瓜分抢食，能存留下来的不足十之一二。但尽管如此，庞大的数量也使得弱丁鱼无需为繁衍苦恼，成为种族生存一道当之无愧的王者。
在热带的浅滩中，还有一种相貌狰狞的宝可梦与太阳珊瑚相伴生存——海刺龙。它栖息在珊瑚枝深处，用背上有毒的刺作为防身武器，每年都有采珊瑚的渔民不慎被它刺伤。
海刺龙的繁衍方式也与众不同。伴侣双方各有领地，不会居住在一起；每天清晨，雌性海刺龙前往伴侣的领地拜访，不光携手捕猎，还会一同跳舞欢歌增进感情。负责抚养后代的公海刺龙将蛋贴在腹部，寸步不离地照顾——与弱丁鱼不同，墨海马的蛋需要经历漫长的几十天才能孵化。
但比起拉普拉斯，这段时间则显得短暂了许多。
每年晚春，拉普拉斯们都会回到它们出生长大的海域。产下卵的拉普拉斯不会再出海远行，和它的伴侣一同留在珊瑚礁生活。即使在水温最高的赤道附近，它们的蛋也需要至少一年的时间孵化，而小拉普拉斯学会游泳和捕猎，能够跟随父母远行则要再花数月时间。尽管如此，离群多年的拉普拉斯依旧能轻易寻找到它的族群——在相隔千里的广袤海洋，它们究竟是如何沟通、又如何找寻彼此，这至今都是一个谜团。
盛夏，暴风雨来临，珊瑚礁面临着史无前例的危机。
大自然拥有着任何宝可梦都无法匹敌的力量。飓风带来的大浪能轻易折断珊瑚枝，将礁石整个撕裂开来。每当雨季到来，敏锐的海刺龙率先动身，太阳珊瑚群则紧随其后，带领着小型宝可梦们浩浩荡荡游向深海，躲避即将到来的灾难。
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